Temario
A través de este curso se espera que los alumnos aprendan a utilizar herramientas basadas en modelado de nicho ecológico para contestar diversas preguntas biológicas
Objetivo
El curso tiene como objetivos el entender los diversos fundamentos teóricos sobre los cuales descansa el modealdo de nichos ecológicos, taels como las unidades a modelar, los conceptos de nicho ecológic y las distribuciones geográficas, así como aspectos importantes, como el modelo BAM, las implicaciones de las transferencias climáticas, las validaciones estadísticas entre otras. Además otro objetivo es abordar los principios y manejo de algunos algoritmos comunes, como BIOCLIM, GARP, Maxent, DOMAIN, etc., para que el alumno pueda aplicar esta herramienta en la solución de preguntas y problemas biológicos.
Objetivos específicos
1)Conocer las bases teóricas del modelado de Nicho Ecológico (MNE) 2)conocer las aplicaciones teóricas y empíricas del modelado de nicho ecológico. 3)Manejar algunos de los algoritmos más comunes
Habilidades y destrezas
Además de contar con los conocimientos sobre SIG, los interesados deben tener mucho interés en aprender usar este tipo de herramientas para contestar preguntas biológicas concretas.
Contenido temático
1. Breve introducción al uso de Sistemas de Información Geográfica y &ldquo,R&rdquo, 2. Introducción: el modelado de nicho como herramienta 2.1 La importancia de la información en la investigación biológica y en la solución de problemas 2.2 La Informática de la Biodiversidad 2.3 Los Modelos de Nicho ¿,qué son y para qué sirven? 3. Las unidades del modelado 3.1 ¿,Qué estamos modelando? Conceptos de especie, subespecie y población 4. Áreas de distribución 4.1 Conceptos y métodos para su determinación 4.2 Análisis de las áreas (areografía) 4.3 Biogeografía Histórica y Ecológica 5. Conceptos de nicho (desde Grinnell hasta Chase & Leibold) 5.1 Los diversos conceptos de nicho 5.2 Variables scenopoéticas y variables bionómicas 5.3 Fisiología/ecología y variables directas e indirectas 6. Del nicho ecológico a la distribución geográfica 6.1 El espacio ecológico y el espacio geográfico 6.2 El Modelo BAM 6.2.1 La importancia de B, de A y de M en el nicho y la distribución 6.2.2 Definiciones de distribución/nicho potencial, actual, etc. 7. Implementación: El proceso de modelación de nichos 7.1 Calibración 7.1.1 Datos de entrada: biológicos 7.1.1.1 Tipos de datos: sólo presencia, presencia/ausencia, presencia/pseudoausencia, presencia/entorno 7.1.1.2 Consideraciones de los datos biológicos: Formatos, Fuentes de datos, Georreferenciación, Errores asociados 7.1.2 Datos de entrada: geográficos 7.1.2.1 Tipos de datos: variables directas e indirectas 7.1.2.2 Consideraciones de los datos geográficos: Formatos, Fuentes de datos, Resolución, Calidad, Temporalidad 7.2 Modelación 7.2.1 Proceso de modelado 7.2.2 Funcionamiento de algunos algoritmos heurísticos (correlativos): Bioclim, GARP, MaxEnt, GLIM, GAM, BRT, Random Forest, Support Vector Machine, etc. 7.2.2.1 Resultados de la modelación: Tipos de salidas: binarias, probabilísticas, de consenso, Selección de modelos 7.2.3 Proyección espacial y transferencia de los modelos en espacio y tiempo 7.2.4 Conservadurismo de nicho 7.2.5 Incertidumbre en el modelado 7.2.6 Validación de los modelos: Pruebas estadísticas, utilidad y limitaciones, Ji-cuadrado, Curva ROC y AUC &ndash, ROC Parcial, Índice Kappa, TSS 8. Interpretación de los modelos y procesamientos post hoc 8.1 Distribuciones potenciales, históricas y actuales 10. Aplicaciones de los modelos de nicho